במחשבים, המונח אלגוריתם מוגדר כאמצעי יעיל לפתרון בעיות תוך ביצוע מספר מוגדר של הוראות. בהקשר של SEO, אלגוריתם מתייחס בעיקר לזה של גוגל העושה שימוש בכמה מאות פרמטרים (מעל 200 לפי גוגל) כדי לקבוע את מיקומי האתרים השונים בתוצאות החיפוש ובהקשר של מילות מפתח שונות. האלגוריתם של גוגל עובר שינויים מדי כמה חודשים כדי לעדכן את הפרמטרים השונים ואת מידת החשיבות של כל אחד מהם.